Náklady na správu jsou klíčovým bodem každého odpadového systému. Ve Zlíně je situace řešena jednoduše a efektivně – výsypy a opravy odpadkových košů jsou hrazeny Magistrátem města Zlína na základě paušální smlouvy s Technickými službami Zlín. Tento model zajišťuje hladký provoz a předvídatelné náklady.
Koše jsou totiž označeny tzv. RFID čipem, díky kterému mohou vozidla pro vývoz košů jednotlivé výsypy snadno evidovat. Fakturace pak probíhá právě na základě počtu výsypů košů.